Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb5Q02739 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb5Q02739 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms