Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd1Q01822 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms