Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HmgcrQ01237 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HmgcrQ01237 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HmgcrQ01237 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms