Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csf2raQ00941 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csf2raQ00941 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms