Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga4Q00651 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga4Q00651 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms