Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il6stQ00560 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Il6stQ00560 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il6stQ00560 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms