Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shc1P98083 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shc1P98083 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shc1P98083 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Shc1P98083 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms