Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Loxl1P97873 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxl1P97873 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms