Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarcc1P97496 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarcc1P97496 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms