Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crmp1P97427 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crmp1P97427 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crmp1P97427 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Crmp1P97427 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms