Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkp1P97350 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkp1P97350 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms