Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mesp1P97309 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp1P97309 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms