Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim43bP86448 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim43bP86448 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms