Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H3f3aP84244 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3f3aP84244 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3f3aP84244 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms