Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpcaP84075 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HpcaP84075 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HpcaP84075 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms