Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gjb6P70689 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb6P70689 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb6P70689 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms