Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp9xP70398 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9xP70398 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms