Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gfi1P70338 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms