Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DccP70211 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DccP70211 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DccP70211 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DccP70211 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DccP70211 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DccP70211 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DccP70211 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DccP70211 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DccP70211 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DccP70211 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DccP70211 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DccP70211 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DccP70211 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DccP70211 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DccP70211 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DccP70211 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DccP70211 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DccP70211 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DccP70211 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DccP70211 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DccP70211 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DccP70211 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DccP70211 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DccP70211 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DccP70211 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DccP70211 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DccP70211 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DccP70211 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DccP70211 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DccP70211 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DccP70211 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DccP70211 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms