Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna1P70206 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna1P70206 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna1P70206 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna1P70206 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna1P70206 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna1P70206 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxna1P70206 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms