Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SbdsP70122 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SbdsP70122 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms