Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx1P63013 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrx1P63013 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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