Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms