Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps3P62908 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms