Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl30P62889 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl30P62889 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl30P62889 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms