Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23P62830 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms