Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra1P62812 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra1P62812 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms