Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23aP62751 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms