Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arf6P62331 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms