Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms