Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpfP62307 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpfP62307 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms