Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps18P62270 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps18P62270 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps18P62270 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms