Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smg6P61406 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg6P61406 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smg6P61406 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smg6P61406 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Smg6P61406 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smg6P61406 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Smg6P61406 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smg6P61406 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smg6P61406 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smg6P61406 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms