Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ActbP60710 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ActbP60710 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ActbP60710 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ActbP60710 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ActbP60710 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ActbP60710 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ActbP60710 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ActbP60710 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ActbP60710 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ActbP60710 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ActbP60710 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ActbP60710 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ActbP60710 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ActbP60710 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ActbP60710 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms