Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia3P60469 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms