Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nup43P59235 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Nup43P59235 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nup43P59235 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nup43P59235 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nup43P59235 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup43P59235 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup43P59235 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nup43P59235 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms