Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdrg1P59048 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdrg1P59048 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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