Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33bP59016 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps33bP59016 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps33bP59016 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms