Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp1P58466 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms