Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c40P56657 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp2c40P56657 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms