Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TdgP56581 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TdgP56581 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TdgP56581 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TdgP56581 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TdgP56581 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TdgP56581 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TdgP56581 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TdgP56581 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TdgP56581 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TdgP56581 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TdgP56581 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms