Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd38P56528 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd38P56528 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd38P56528 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd38P56528 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms