Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckbrP56481 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CckbrP56481 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms