Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp5P56399 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms