Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GferP56213 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GferP56213 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GferP56213 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GferP56213 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GferP56213 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GferP56213 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GferP56213 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GferP56213 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GferP56213 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms