Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcanP55066 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcanP55066 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NcanP55066 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcanP55066 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcanP55066 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NcanP55066 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NcanP55066 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcanP55066 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NcanP55066 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NcanP55066 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NcanP55066 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NcanP55066 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcanP55066 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcanP55066 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcanP55066 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcanP55066 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NcanP55066 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcanP55066 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcanP55066 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcanP55066 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcanP55066 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcanP55066 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NcanP55066 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NcanP55066 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcanP55066 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcanP55066 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NcanP55066 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NcanP55066 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NcanP55066 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NcanP55066 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NcanP55066 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms