Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Faf1P54731 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Faf1P54731 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 673.3 ms