Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RabggtbP53612 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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