Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lhx3P50481 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lhx3P50481 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lhx3P50481 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms