Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl5P50228 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms